Nowe warianty koronawirusa SARS-CoV-2
Koronawirus ulega spontanicznym mutacjom i choć zmienia się w mniejszym stopniu niż inne wirusy typu RNA (np. wirus grypy czy WZW C, czyli HCV), wciąż powstają nowe jego warianty, które rozprzestrzeniają się po świecie i zaczynają dominować na różnych obszarach.
Warianty koronawirusa, z którymi zmagamy się w 2021 roku, są inne niż te pierwotne. Teraz COVID-19 częściej dotyka osób młodych i jest bardziej zaraźliwy, choć niekoniecznie powoduje poważne powikłania, bo wirus nie jest tak zjadliwy. Wyższa liczba zakażonych to jednak wyższa liczba zgonów, nowe wersje nie są więc wcale mniej groźne. Co więcej, nowe warianty SARS-CoV-2 mogą wywoływać koinfekcję.
Naukowcy pocieszają, że koinfekcje wirusami nie zdarzają się tak często, jak wspólne infekcje wirusów i bakterii, choć odnotowano np. jednoczesne przypadki grypy i COVID-19. Choć niektórzy uczeni uspokajają, że wirusy nie mogą też kombinować się ze sobą w organizmie gospodarza, w przypadku nowego patogenu stare zasady po raz kolejny mogą się nie sprawdzać.
Koinfekcje tych samych komórek różnymi wariantami koronawirusa SARS-CoV-2 są jak najbardziej możliwe. Często prowadzą do powstawania wariantów o nowych sekwencjach genów i przyspieszyć proces dominacji kolejnych wersji patogenu. Wykazano to zarówno w laboratorium, jak i bezpośrednio u pacjentów z COVID-19.
Dowiedz się więcej na temat:
Przypadki koinfekcji różnymi wariantam i szczepami wirusa u chorych z COVID-19
Zagrożenie nowymi, bardziej groźnymi wariantami koronawirusa to problem, który zyskał uwagę naukowców dopiero pod koniec 2020 roku. Dzięki zebranym danym i inwestycjom w nowoczesny sprzęt badania struktury wirusów są coraz liczniejsze, choć oczywiście ze względu na specyfikę i koszty pracy nie ma ich jeszcze wiele.
Niedawne doniesienia na temat koinfekcji w brazylijskim stanie Rio Grande do Sul to wcale nie pierwsze takie przypadki. Jak wykazali badacze z Uniwersytetu Feevale, u jednego z pacjentów z COVID-19 z grupy 90 badanych doszło do jednoczesnego zakażenia wariantem brazylijskim (B.1.1.28, znany także jako szczep P.2) oraz japońskim (B.1.1.248), a u innego – wariantem brazylijskim i szwedzkim (B.1.1.28 oraz B.1.9). Pacjenci w wieku ok. 30 lat nie wymagali hospitalizacji ze względu na łagodny przebieg infekcji.
Występowanie koinfekcji różnymi szczepami koronawirusa SARS-CoV-2 potwierdzono jednak już w czerwcu 2020 roku. Należy przy tym wyjaśnić, że szczep to wariant koronawirusa, który ze względu na różnice w budowie spowodowane mutacjami wykazuje wyraźnie odmienne właściwości.
Gdy amerykańscy badacze z Illinois Computer Science poddali analizie 621 próbek RNA koronawirusa i 7540 próbek pobranych od pacjentów z COVID-19, zidentyfikowali liczne szczepy wirusa u zarażonych oraz dowody na konfekcje ich odmiennymi rodzajami.
Różnorodność genów SARS-CoV-2 w próbkach od zarażonych pacjentów może mieć związek z kilkoma zjawiskami. To ewolucja koronawirusa w organizmie po zakażeniu pojedynczym szczepem, a także pojedyncza infekcja spowodowana przez wiele odmiennych genetycznie szczepów lub superinfekcja, gdy następują po sobie oddzielne zakażenia.
W badaniu uczonych z Illinois w 62 proc. próbek wykazano różnorodność genetyczną koronawirusa. W podczas gdy jednak w 67 proc. próbek wykryto pojedynczy szczep koronawirusa, u 11 proc. pacjentów, od których pochodził materiał, potwierdzono infekcję co najmniej 2 szczepami SARS-CoV-2.
Biologiczną różnorodność infekcji koronawirusem SARS-CoV-2 oceniono też w irackiej prowincji Babilon we wrześniu 2020 roku. W poszukiwaniu wariacji w budowie białek kolca zbadano sekwencję kodujących je genów u 19 osób z objawami COVID-19. Co szokujące, wykazano w nich jednoczesne występowanie aż 15 wariacji. Zbadane osoby były zainfekowane co najmniej 2 różnymi szczepami wirusa pochodzącymi z odmiennych źródeł. W żadnym z tych przypadków zakażenia nie wywołał pojedynczy wariant koronawirusa.
Przeczytaj także:
Źródła:
- Unexpected Co-infection with Different Strains of SARS-CoV-2 in Patients with COVID-19 Preprints
- Coronavirus: what happens when a person is simultaneously infected with two variants? The Conversation
- Research Finds Multiple COVID-19 Strains Can Co-Exist in Patients The Carl R. Woese Institute for enomics Biology
- Pervasive transmission of E484K and emergence of VUI-NP13L with evidence of SARS-CoV-2 co-infection events by two different lineages in Rio Grande do Sul, Brazil medRxiv
ZOBACZ: Nowy wariant koronawirusa pochodzi z Finlandii