Długotrwały stres niszczy mózg, zanika w nim bowiem istota szara, a na uszkodzenie najbardziej narażony jest hipokamp i kora przedczołowa, gdzie znajduje się nasze „superego”. Te części mózgu odpowiadają za funkcje poznawcze takie jak planowanie, podejmowanie decyzji, przewidywanie ich konsekwencji, pamięć oraz emocje.

Spowodowane stresem zmiany w mózgu da się odwrócić, ponieważ narząd ten jest bardzo plastyczny. Trzeba mu jednak zapewnić odpowiednią ilość odpoczynku, aby mógł się zregenerować.